Поскольку sed не использует регулярные выражения, а вместо регулярных выражений использует морально устаревшее, труднообъяснимое, мало понятное непойми что, мы его заменим конструкцией

perl -0777pe 's/search/replace/g' -i filename

Где

-0777 - символ, использующийся в качестве построчного разделителя вместо стандартного \n (значения от 0400 и выше заставят perl обработать сразу весь файл целиком в один заход, но 0777 является общепринятым соглашением для этой цели).
-p - встраивает вводимый вами код на perl в "печатающий цикл", который будет обрабатывать stdin построчно.
-e - Позволяет передать исполняемый код в качестве аргумента, а не файла.
-i - Заменяет строки указанного входного файла на результаты вывода perl.

Живой работающий пример:

perl -0777pe 's#(\s+else[\s]+)cnf="\$1/openssl.cnf"(\s+fi)#$1cnf="\$1/openssl-1\.0\.0\.cnf"$2#g' -i /etc/openvpn/easy-rsa/2.0/whichopensslcnf

Пользителка (пользявка) для .bashrc

greplace()
{
  perl -0777pe "$1" -i $2
}

Или, что еще удобней и безопасней (-i надо добавлять вручную, чтоб заменило, а без -i в stdout для отладки выводить будет просто):

greplace()
{
  perl -0777pe "$1" $2 $3
}

А теперь заменим все "echo" внутри файла filename на адрес нашего айпишника, который выдаст нам curl из своего stdout (при условии, что сервис по адресу http://myip.dnsomatic.com доступен и работает исправно, чего я гарантировать не могу).

greplace 's/echo/'`curl -s http://myip.dnsomatic.com`'/g' -i filename

На случай, если http://myip.dnsomatic.com или какая-либо другая команда, будет возвращать данные с пробелами или символом ", обернём `curl -s http://myip.dnsomatic.com` в "".

greplace 's/echo/'"`curl -s http://myip.dnsomatic.com`"'/g' -i filename

И ещё можно вынести за скобки s

greplace()
{
  perl -0777pe s"$1" $2 $3
}

и писать вот так

greplace /search/replace/g filename

Правда без использования кавычек \ придётся экранировать: \\

greplace /\\s+/_/g filename

Спасибо всем этим прекрасным людям, лучшим сынам своего отечества, без которых этот пост был бы невозможен:
http://stackoverflow.com/questions/3365260/match-and-replace-multiple-newlines-with-a-sed-or-perl-one-liner
http://stackoverflow.com/questions/6302025/perl-flags-pe-pi-p-w-d-i-t
http://perldoc.perl.org/perlrun.html#Command-Switches